Дисципина «Клиническая фармакология» была введена в 1983 года в виде цикла на лечебном факультете, цикл возглавлял профессор, д.м.н Шалхаров С.Ш, с 1985 года цикл был преобразован в курс, который возглавил доцент Тузельбаев Н.К. В 1990 году впервые в Казахстане была открыта кафедра клинической фармакологии. До 2000 года заведовал кафедрой д.м.н, профессор И.Р. Кулмагамбетов. С 2001 по 2002 год кафедра была реорганизована в курс при кафедре фармакологии (зав. кафедрой д.м.н., профессор Пичхадзе Г.М.), в 2003 году курс вошел в состав кафедры внутренних болезней (д.м.н., профессор Изатуллаев Е.А., затем – к.м.н., доцент Ташенова Л.К).

Под руководством д.м.н., профессор Жанпеисовой А.А кафедра клинической фармакологии, ЛФК с физиотерапией была вновь создана в сентябре 2003 года. Асия Ахмеджановна отдала университету 32 года и возглавляла кафедру до сентября 2012 год.

С сентября 2012 года заведует кафедрой проф. д.м.н Кайрбеков А.К.

ППС кафедры преподает дисциплины «клиническая фармакология», «фармакотерапия», «ЛФК и физиотерапия». ППС по клинической фармакологии: зав. кафедрой д.м.н ., профессор Каирбеков А.., профессоры Жанпеисова А.А., Кунанбай К., Касымова Г.П., к.м.н., доценты: Калиева М.М., Таганиязова Г.Ш., Исина З.Б., Мырзабаева Н.А., ассистенты: Ералиева Б.А., Киекова Б.Х., Нургазиева Г.Е., Турсынбаева Ж.Д., Мубаракшинова Д.Е., Уваисова М.Х. по ЛФК и физиотерапия ассистент: Ибраева О.Ш.

В состав дисциплин, преподаваемых на кафедре с 2010 года вошла дисциплин «спортивная медицина», ответственная д.м.н., проф. Касымова Г.П.

«Физиотерапия и ЛФК» стал преподаваться в АГМИ с 1970 г. в виде курса (доцент Колесникова Н.К). В 1980 г. курс был преобразован в кафедру (д.м.н. Буркашов А.Б.), затем в виде курса дисциплина преподавалась на кафедрах терапевтического профиля до 2003 г.

На кафедре обучаются студенты всех факультетов университета, как на додипломном уровне (по специальностям Фармация, Общая медицина), так и постдипломном (интерны, резиденты по клиническим направлениям подготовки). Начато обучение по кредитной технологии, разработаны новые элективные дисциплины.

На кафедре имеется вся необходимая документация. Профессор, д.м.н. Жанпеисова А.А. является автором типовой программы по клинической фармакологии (по ГОСО 2006г.), учебника “Клиникалық фармакология және фармакотерапия”; “Сборника тестовых заданий по клинической фармакологии”; методических указанией “Клинико-фармакологическая экспертная оценка эффективности лечения больного”; “Науқасты емдеудің клинико-фармакологиялық тұрғыдан сараптамалық бағалау”и.т.д.

На кафедре проводится НИР по изучению действия лекарственных средств, обеспечения эффективного и безопасного лечения, клинической апробации новых лекарственных средств, отработки новых способов оценки эффективности проводимой терапии. Под руководством заведующей к 20-летию независимости РК кафедры провела Международную практическую конференцию «Проблемы и перспективы клинической фармакологии» с участием докладчиков из США, Франции, Сербии, Болгарии, Узбекистан и Киргизии.

Сотрудники кафедры активно привлекают студентов к выполнению НИРС, ежегодно работы, выполненные студентами, отмечаются грамотами и призовыми местами в университете, имеются публикации студенческих работ.

ППС кафедры проводит лечебно-консультативную работу в различных отделениях базовых клиник (ГКБ№1, ГП№4, ГП№5, КазНИИ кардиологии и внутренних болезней, ГКЦ); проводятся научно-практические конференции семинары среди врачей по безопасности применения лекарственных средств, циклы лекций, санитарно-просветительная работа среди населения.

Сотрудники кафедры уделяют большое внимание воспитательной работе среди студентов. За организацию выездного музея Кунаева Д.А. с привлечением его соратников, представителей ректората, деканов всех факультетов кафедра была отмечена грамотой музея Д.А.Кунаева.

С 2012 года впервые на кафедре ведется преподавание на английском языке по элективной дисциплине «Взаимодействие и побочное действие лекарственных препаратов».

Кафедра имеет международные связи с медицинскими университетами Польши (профессор Косич И.), России (профессор Сычев Д.А.), Киргизии (профессор Тилекеева У.М.)