Ректордың бұйрығы бойынша, 2009 жылдың қыркүйегінде, хирургия бойынша дипломнан кейінгі дайындық кафедарасы құрылған. Кафедраның оқу процесі жүргізілетін негізгі базасы болып А.Н. Сызганов атындағы ҰҒХО болды, ал кафедра меңгерушісі қызметіне профессор Дайырбеков О.Д тағайындалды. Кейінде, интернатура бойынша екі жылдық оқуды қарастыратын жаңа мемлекеттік стандартқа көшуіне байланысты,2 жаңа кафедра құрылған, қазіргі кезде хирургия бойынша интернатура және резидентура №1, №2 кафедрасы деп аталады. Содан кейін интернатура бойынша бір ган кафедра қалғандықтан, қазіргі кезде кафедра атауы «Хирургии №2», ал кафедра меңгерушісі болып қазіргі кезде раазанов Манас Ембергенович тағайындалды

Кафедра профессорлық- оқытушылық құрамы негізінен мамандық бойынша үлкен тәжірибиесі бар , оның ішінде 73% ғылыми дәрежесі мен атағы бар тәжірибиелік қызметкерлерден тұрады. Қазіргі кезде университет саясатына сүйінетін болсақ 3 тілде оқыту формасы енгізілгенмен, кафедрадағы оқыту мемлекеттік және орыс тілінде жүргізіледі. Сол себеппен, ағылшын тілін игеретін қызметкерлерді дайындау қарқынды жүруде.

Университетте сияқты кафедрада интерн хирургтарға компетенттік оқыту жүргізіледі. Оқу жүйесі негізінде модульдік жүйе қарастырылған, бұл жүйе бойынша интерндер 2 жыл ішінде хирургия бойынша хирургия бойынша 4 модульді өтуі міндетті, сонымен қатар шектес пәндерді де өтеді. Бұдан басқа, резиденттерге арналған мынадай : ангиохирургия, офтальмология, спорттық медицина, травматология бойынша кескінді сабақтас «Жалпы хирургия» цикл бойынша оқыту жүргізіледі.

Кафедарада қазіргі таңда 1 оқытушы жұмыс жасауда.( оның ішінде 6 профессор, 6 доцент , 3 ассистент).

Кфедра жұмыскерлері клиникалық базаларында жүктемесін толықтай орындап, ғылыми жұмыстарымен айналысуда,сонымен қатар хирургияға замануи технологияларды енгізуге үлкен үлес қосуда. Қазіргі кезде кафедра 4 клиникалық базаларда орналасқан;

– негізгі базасы: ҚКА №7 ( Калкаман) Алматы. Қосымша базалары : ОҚКА, Сызганов атныдағы ҰҒҚО, ЖККША Алматы

Кафедра мақсаты — Хирург – дәрігерлерінің дайындығының сапасын жоғарлату.