Самостоятельный курс туберкулеза АГМИ выделен в 1935 году, на должность приват-доцента был выдвинут Байгурин Альжан Махмудович, молодой ученый, знавший несколько языков, однако в 1938 году он был репрессирован и погиб. На базе курса 12 ноября 1941 года по приказу Комитета по делам высшей школы СНК СССР была организована кафедра.
Первым заведующим кафедрой был эвакуированный в годы ВОВ из г. Ленинграда профессор М.Р.Борок. В разные годы кафедрой заведовали заслуженные врачи и выдающиеся деятели науки РК – профессор Зюзин В.И. (1943-1964), доцент Хасенов А.Н. (1964- 1975), академик и Вице президент Академии Естественных наук РК, профессор Маскеев К.М. (1975-1996), академик АН, РАМН, Гамбургской академии медицины и профилактики, Польской медицинской академии, президент Ассоциации фтизиатров Казахстана профессор Муминов Т.А.(1996-2002). С 2002 года кафедру возглавляет д.м.н., профессор Ракишева А.С. На работают: академик Т.А. Муминов, заслуженный деятель науки РК профессор К.М. Маскеев, доктор медицинских наук Н.А. Бейсебаев, доценты: Б.С. Дюсенбекова, Н.С. Сыздыкова, Б.Т. Кумисбаева, Л.Ш.Касенова, А.Г. Исаева, У.Т. Макулбаева, Г.С. Еркенова, ассистенты: к.м.н. В.В. Шацких, к.м.н. Ч.Т. Нуркабаев, к.м.н. Г.У. Есетова, к.м.н. П.М. Джазыбекова, Г.А. Ауельбекова, Ш.К. Жумабаева, Х.М. Даутова, Н.Р. Сейтханова, Ю.В. Репина, стажер-преподаватель А.Х. Ишингалиева, резиденты А. Кунанбаева, А.Тилешова, лаборант Г.С. Байжанова.
В учебном процессе используются интерактивные методы обучения – работа в малых группах, метод «круглого стола», «мозгового штурма», моделирование клинической ситуации, PBL, ролевые игры, скейтч-ком. Для повышения эффективности образовательного процесса используются новые информационные технологии, такие как электронные учебники — «Международные стандарты диагностики и лечения туберкулеза», клинико-рентгенологический атлас «Туберкулез легких и его дифференциальная диагностика» академика Муминова Т.А., видеоролики, часть из которых создана преподавателями кафедры.
Кафедра занимается также постдипломным повышением квалификации врачей по фтизиатрии, обучением врачей-интернов ВОП, терапевтов, педиатров и резидентов.
Научно-исследовательская работа на кафедре ведется по разным направлениям теоретической и практической фтизиатрии. Выполнялись НТП МЗ РК, грант Фонда Первого Президента, внутривузовские гранты (проф. Ракишева А.С.), грант Центра изучения глобального здоровья в Центральной Азии Колумбийского Университета (проф. Муминов Т.А.).
Сотрудники кафедры заняты не только учебно-педагогическим процессом, а также принимают активное участие в международной научной жизни: выступают с докладами и сообщениями на международных конгрессах и симпозиумах, публикуются в зарубежных изданиях. В рамках программы визитинг-профессоров кафедра фтизиопульмонологии организовала лекции ведущих специалистов по фтизиатрии. За последние 3 года подготовлены и изданы: 2 учебника, учебно-методические пособия – 2, монографии – 3, руководства – 4
Важная роль на кафедре отводится воспитанию будущего врача, не только грамотного клинициста, а разносторонней развитой личности. Ежегодно сотрудники кафедры организуют встречи для студентов с ветеранами локальных конфликтов «Опаленные Афганистаном», проводят тематические круглые столы по проблеме формирования ЗОЖ, по противодействию коррупции. Ежегодно в общежитиях университета, ВУЗах и школах города студентами и преподавателями кафедры проводятся лекции и беседы о раннем выявлении и профилактике туберкулеза, межвузовская студенческая конференция, посвященная Всемирному Дню борьбы с туберкулезом.